4月，一个国际团队报告了一项独立评估的结果，该评估是对五种商业上可用于肿瘤DNA测序检测方法进行的独立评估的结果，这是一种快速，廉价且侵入性小的方法，可以用于诊断和监测癌症。

研究人员发现，当所有检测物占血液中总DNA的0.5％时，所有测定法都可以可靠地检测出所谓的循环肿瘤DNA（ctDNA），这种敏感性水平可以用于检测，遗传分析和监测晚期、转移性肿瘤。

相关结果公布在Nature Biotechnology杂志上，这是将ctDNA分析用作癌症诊断的一个重要里程碑，研究论文也概述了最佳实践指南，并揭示了未来发展的关键领域。

这项研究是由Garvan医学研究所，FDA国家毒理学研究中心和阿肯色大学合作完成。这是FDA主导的Sequencing Quality Control phase 2项目的一部分，该项目旨在开发标准协议和质量控制指标，以便在精密医学中使用新一代测序。

“为了使ctDNA检测对临床患者有益，他们需要准确，一致地检测不同实验室和样品中的癌症突变。我们的研究是迄今为止ctDNA检测中对分析性能的最全面评估，它代表了重要的意义。 Garvan研究所的第一作者Ira Deveson博士说。

新一代测序可监测癌症DNA

当癌细胞发育时，它们会在其DNA中积累突变，当癌细胞降解时，其片段也会进入血流。得益于新一代测序的测定方法，这些ctDNA片段现在可以在患者的血液样本中检测到，用于鉴定和监测癌症，替代更具侵入性的组织活检。

但是，尽管ctDNA测定法已在精确肿瘤学临床试验中被采用，但研究人员和临床医生仍对目前的测定法的准确性存在疑问，相关技术还需要改进，需要定义ctDNA测序适合的应用程序，然后才能在临床实践中广泛实施ctDNA测序。

在最新研究中，来自欧洲，亚洲和美国的12个实验室的研究人员评估了Roche Sequencing Solutions，Illumina，Integrated DNA Technologies和Burning Rock Dx和Thermo Fisher Scientific等目前业界领先公司产品的ctDNA测定性能。

他们使用合成实验和模拟ctDNA参考样品测试了这些检测方法。分析结果表明，当ctDNA突变水平较高（高于0.5％，与晚期和转移性肿瘤一致），这些检测方法都可以以相对高的灵敏度，精密度和可重复性检测出。但是，当ctDNA水平较低时（与早期癌症或疾病复发的早期征兆相符），不同的检测方法结果存在差异，不一致。

研究人员在其发表的论文中概述了ctDNA检测未来发展的重点，他们说这将有助于推动该技术在临床上的应用，监测肿瘤的进展，以及对治疗的反应、预测癌症的复发。

医学博士Donald Johann Jr.表示：“我们的发现表明，参与实验的ctDNA分析可能适合于晚期癌症患者的分子分层和肿瘤演化分析。这有助于为进行ctDNA分析更高级的临床试验扫清道路。”

“了解当前的检测限制是朝着将来可以常规使用血液检测作为癌症筛查工具迈出了关键一步。这项至关重要的研究是对ctDNA检测的全面分析评估，定义了诊断限制，评估了可重复性，并确定了关键影响性能的实验变量，”美国FDA国家毒理学研究中心的Joshua Xu博士说。

“我们的独立性能分析是推动新一代测序方法用于癌症检测和治疗的关键机制。我们希望这将有助于提高在早期诊断肿瘤中的敏感性和可靠性。”

（生物通：万纹）

原文链接：

Evaluating the analytical validity of circulating tumor DNA sequencing assays for precision oncology

http://dx.doi.org/10.1038/s41587-021-00857-z