乳腺组织由多种细胞组成，包括上皮细胞(粉色)、免疫细胞(青色)和脂肪细胞(黑色)。
资料来源:卡米拉·多斯桑托斯/多斯桑托斯实验室，CSHL/2021
如果能预测哪些细胞会癌变?
在女性的一生中，乳房组织会发生巨大的变化，因此找到可能导致癌症的突变标记尤为困难。冷泉港实验室(CSHL)副教授Camila dos Santos和她的团队鉴定并分类了数千种正常的人类和小鼠乳腺细胞类型。新的目录重新定义了健康的乳房组织，这样，当出现问题时，科学家们可以精确地找到它的起源。
任何乳腺细胞都可能癌变。
“为了了解乳腺癌的风险，你必须首先了解正常的乳腺细胞，所以当我们考虑预防性甚至靶向治疗时，你将阻止正确的细胞类型发展为癌细胞。”
一种传统的细胞分类方法是通过追踪一些与细胞功能相关的标志性基因。为了更广泛地对细胞进行分类，dos Santos的团队转向了一种被称为单细胞RNA测序的技术。他们追踪了小鼠和人类乳房组织中超过15000个细胞中几个基因的活动。石溪大学多斯桑托斯实验室的常驻研究生Samantha Henry说:
“我们确实为每个细胞群体创建了许多基因的完整目录，以便更好地定义它们。当我说有很多基因的时候，确实有很多基因，这花了很长时间。”
一组细胞包括雌激素受体阳性细胞，它们通常易于治疗。但是dos Santos的团队发现，这个群体可以分为几个亚群体，每个亚群体对治疗可能有不同的反应。
该团队与计算生物学家CSHL教授Adam Siepel和他的团队合作，发现小鼠和人类乳腺细胞有相似的基因图谱，这说明了为什么在小鼠身上进行的研究可能与人类相关。dos Santos实验室的计算机科学开发人员Marygrace Trousdell说:
“我们总是发现自己很难对某些细胞类型进行明确的分类。有时我觉得我已经看到了所有的基因，然后其他的就会冒出来。”
目前，该实验室正试图将正常的基因转移与与癌症相关的基因转移区分开来。乳腺细胞类型目录能指出需要监测的细胞类型，并为研究人员指明未来的治疗方案。
原文检索：Characterization of Gene Expression Signatures for the Identification of Cellular Heterogeneity in the Developing Mammary Gland
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