蛋白质是我们细胞过程中的关键角色。他们这一代遵循的原则被称为转录和翻译。首先,DNA将其遗传信息复制到信使RNA(信使RNA),然后由信使RNA决定氨基酸链的序列,氨基酸链最终折叠成蛋白质。然而,现实更为复杂:超过90%的基因不会只产生一个信使RNA,然后产生一个蛋白质,而是一种称为选择性剪接的过程产生了几个mRNA变体,只有其中的一部分在特定的时间被翻译成特定细胞中的特定蛋白质亚型。传统的检测选择性剪接的技术大多是单时间点的测量,工作强度大,不能可靠地监测随着时间的推移哪些蛋白质异构体在细胞中实际翻译。

亥姆霍兹慕尼黑中心和慕尼黑技术大学(TUM)开发了一种新的生物工程报告系统,称为EXSISERS。其背后的想法是,一旦特定的蛋白质异构体被翻译,就会产生一种信号,如光。“这是可能的,通过设计师报告蛋白,可以切断自己的新生氨基酸链-它们是自激发的,”Dong-Jiunn Jeffery Truong说。“与魔术表演中著名的切割和恢复绳索技巧类似,切除报告者在天然蛋白质异构体中不会留下疤痕。”研究人员已经将这种方法应用于培养中的人类细胞。他们的目的之一是分析一种名为Tau的蛋白质的异构体的表达,这种蛋白质与帕金森氏症等神经退行性疾病有关。这使得Tau异构体成为未来分子治疗的潜在靶点。

“受自然生物分子过程启发的生物工程将使非侵入性观察许多其他基本细胞过程成为可能,”Gil Gregor Westmeyer说。“我们能监测的细胞参数越多,我们就越能为将来的细胞治疗开发出有针对性的分子干预,例如,Westmeyer和他的团队已经在与几个学术实验室合作,这些实验室使用新的报告系统来更全面地了解细胞中的异构体表达及其在疾病中的意义。”

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原文检索:Non-invasive and high-throughput interrogation of exon-specific isoform expression