我们的基因组给我们的细胞指令,这些指令决定了每一种细胞类型高度专门化的功能。信息通过两种不同类型的RNA分子发送出去:一种是将DNA转化为蛋白质的编码RNA,另一种是不产生蛋白质的非编码RNA。
由于非编码RNA分子不产生蛋白质,它们在过去一直不是研究的重点,尽管它们大约占我们体内RNA的97%。然而,某些被称为RNA结合蛋白的蛋白质已经被证明在癌症中发挥了关键作用,因为它们能够影响RNA分子的几种不同性质。
“在肝癌患者捐赠的组织材料的帮助下,我们已经能够绘制我们基因组的编码和非编码部分,以确定哪些rna结合蛋白在肝癌细胞中高度存在。”该研究的资深作者、卡罗林斯卡学院微生物、肿瘤和细胞生物学系研究员克劳迪娅·卡特说。“我们发现,许多这些蛋白质与一种长类型的非编码RNA分子,即所谓的lncRNA相互作用。”
研究团队对rna结合蛋白(CCT3)和lncRNA分子(LINC00326)的特异性配对进行了更详细的研究。利用先进的CRISpR技术,他们能够减少和增加蛋白质和lncRNA的数量,以观察它是如何影响癌细胞的。当lncRNA增加时,肿瘤细胞的脂肪库减少,细胞分裂停止,许多癌细胞死亡。在实验室研究之后,结果也在体内得到验证。
还有更多的组合有待研究
研究人员的发现提供了对rna结合蛋白和lncRNA分子之间相互作用的深入了解,并有助于更好地科学理解它们在肿瘤中的作用。
该研究的第一作者Jonas Noslash说:“CCT3-LINC00326对的活性已经可以用于肝癌的诊断和预后。”他是卡特研究小组的研究员。“然而,对这种特殊配对的了解仅仅是开始,我们还将进一步研究更多的rna结合蛋白和lncRNA分子的组合。从长远来看,这些发现有助于开发新的、有效的治疗方法,比如只针对病变细胞的rna治疗方法,并有可能减少副作用。”
Journal Reference:
Jonas Noslash;rskov Søndergaard, Christian Sommerauer, Ionut Atanasoai, Laura C Hinte, Keyi Geng, Giulia Guiducci, Lars Bräutigam, Myriam Aouadi, Lovorka Stojic, Isabel Barragan, Claudia Kutter. CCT3-LINC00326 axis regulates hepatocarcinogenic lipid metabolism. Gut, 2022; gutjnl-2021-325109 DOI: 10.1136/gutjnl-2021-325109