猴痘病毒的第一个基因组序列草案于上周晚些时候公布，该基因组序列来自于对当前疫情确诊病例的皮损处拭子。5月19日，由葡萄牙里斯本国家卫生研究所Doutor Ricardo Jorge (INSA)传染病系研究员João paulo Gomes博士领导的研究小组在virological.org网站上公布了这一序列。
目前世界各地有近200例与最近的疫情有关的猴痘(确诊和疑似)病例。
这组作者写道:“确定引起这些感染的病毒的基因组序列肯定有助于更好地了解流行病学、感染源和传播模式。”
这项工作几乎在发布后立即得到了科学界的赞扬。
悉尼大学病毒学家、进化生物学家Eddie Holmes博士在推特上发文称，“与新冠疫情有关的冠状病毒”的第一个基因序列草案在2020年1月10日发布。就像猴痘序列一样，它只花了几周的时间就产生了数据并发布在网上。SARS-CoV-2序列是通过上海复旦大学病毒学家张永振博士的工作公布的。
猴痘病毒是一种有包膜的双链 DNA 病毒，基因组大小约为 190 kb。 它属于痘病毒科的正痘病毒属。
发表在www.virological.org上的论文是与影响世界多个国家的大规模爆发有关的猴痘病毒的第一个基因组序列草案。该病毒是5月4日从一名患者皮肤病变处采集的拭子中提取的，使用Oxford Nanopore MinION进行了测序。
该团队随后迅速对病毒进行了系统发育分析。在此过程中，他们发现2022年的病毒属于西非进化支。事实上，在最近爆发的疫情中，西非分支现在已在至少6例病例中得到确认。
猴痘病毒有两个支系:西非支系和刚果盆地(中非)支系。西非猴痘病毒感染分支的病死率(约为1%)低于刚果盆地分支(高达10%)，可导致某些人患上严重疾病。然而，这种疾病通常会痊愈。
系统发育分析还表明，疫情中传播的病毒与2018年和2019年从尼日利亚向英国、以色列和新加坡等几个国家输出猴痘病毒相关的病毒关系最为密切。
这些发现引起了南非西开普省Stellenbosch大学教授、流行病应对与创新中心(CERI)以及夸祖鲁-纳塔尔研究创新与测序平台(KRISp)主任Tulio de Oliveira博士的兴趣。
作者指出，这些数据是初步的，“将在新的基因组数据发布后很快更新。”他们还表示，未来不断增加的这些病毒基因数据对阐明目前正在传播的病毒的起源和国际传播至关重要。