由ICREA研究员、巴塞罗那IRB大分子组装结构表征实验室负责人Maria Macias博士和奥地利生物技术公司ApEpTICO的Susan Tzotzos博士领导的合作工作,揭示了solnatin的结构。一种正在测试的用于肺渗透性水肿介入治疗的分子。在这方面,这项工作使科学家能够详细研究solnatide的作用机制及其与细胞钠通道ENaC的相互作用,ENaC负责清除肺液体。

维也纳ApEpTICO公司是solnatide的所有者,多年来一直在研究这种分子的生物功能。目前,Solnatide正在进行临床试验,用于治疗中度至重度急性呼吸窘迫综合征(ARDS)和COVID-19患者。

马西亚斯博士说:“我们的工作重点是描述肽的结构,并提出一种行动机制,为可能的改进其序列铺平道路,也就是说,小的修改可以使其更有效。

细胞钠通道的结构已经部分描述过了。然而,对于一个尚不清楚的结构不那么清晰的区域,却缺乏详细信息。这项研究发表在《计算与结构生物技术杂志》上,研究人员使用结构预测工具,包括Alphafold2,来识别细胞质一侧与细胞膜对齐的螺旋区域。这个螺旋有一个带正电荷的区域和一个带负电荷的区域。

此外,solnatide有一个称为偶极子的区域,带有一个负电荷和一个正电荷。因此,研究人员能够预测这将是两种结构之间的相互作用点,以及它们在这种相互作用下将如何定位。

来自巴塞罗那加泰罗尼亚生物技术公司BCN多肽、美国奥古斯塔大学佐治亚医学院和埃默里大学亚特兰大医学院的研究人员也参与了这项工作。

原文标题:

pau Martin-Malpartida, Silvia Arrastia-Casado, Josep Farrera-Sinfreu, Rudolf Lucas, Hendrik Fischer, Bernhard Fischer, Douglas C. Eaton, Susan Tzotzos & Maria J. Macias
Computational and Structural Biotechnology Journal(2022) DOI:10.1016/j.csbj.2022.04.031