摘要

尽管在癌症免疫治疗方面取得了突破，但由于免疫抑制环境，大多数肿瘤反应性T细胞不能在实体肿瘤中持续存在。我们开发了Tres(肿瘤弹性T细胞)，一个利用单细胞转录组数据识别对免疫抑制信号有弹性的T细胞特征的计算模型，如转化生长因子-β1，肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体和前列腺素E2。使用接受免疫检查点抑制剂(n = 38)的患者治疗前肿瘤的大量T细胞转录组数据，Tres可靠地预测了黑素瘤、肺癌、三阴性乳腺癌和B细胞恶性肿瘤患者对免疫治疗的临床反应。嵌合抗原受体T细胞治疗的输注产品(n = 34)和嵌合抗原受体T细胞或肿瘤浸润淋巴细胞治疗的预制造样品(n = 84)。此外，Tres还发现FIBp是许多实体肿瘤中抗肿瘤T细胞的首选阴性标记物，其功能大部分未知。在小鼠和人供体CD8+ T细胞中，FIBp敲除显著增强了体外共培养中T细胞介导的肿瘤杀伤作用。此外，在小鼠T细胞中敲除Fibp可以增强B16肿瘤模型中过继细胞转移的体内疗效。Fibp敲除T细胞表现出降低胆固醇代谢，从而抑制效应T细胞功能。这些结果证明了Tres在识别T细胞有效性的生物标志物和实体肿瘤免疫治疗的潜在治疗靶点方面的实用性。