根据美国微生物学会杂志“应用与环境微生物学”杂志上发表的一篇论文，采样环境是检测口蹄疫的有效方法。

采样方法，擦拭饲养牲畜的环境表面，可以很容易地进行，并且可以检测出可以在环境中持续存在的病毒遗传物质，远远超过牲畜停止出现疾病临床症状的时间。与服用临床样本不同，那些服用样本的人无法识别口蹄疫的临床症状。因此，发展中国家的小农可以取样来代替兽医。

在这项研究中，调查人员在尼泊尔加德满都谷地的9个不同地点的24个小农户的每个农场中从许多环境表面采集了拭子，当地的兽医技术人员在那里确定了该病的临床症状。调查人员从饲养牲畜的棚屋，房屋周围的区域以及动物所在的其他地方取了拭子。他们将这些样本送到英国萨里pirbright的pirbright研究所进行评估，Colenutt博士是博士后科学家。“未来，我们希望能够应用便携式诊断技术在该领域取得快速成果，”Colenutt博士说。

该研究中的大部分农场都是“一个家庭的房子和他们饲养动物的房子周围的少量土地”，第一作者，Claire Colenutt博士说，他解释说这些都是自给自足的农民，“谁可能拥有”几头奶牛和几只山羊。“

人类不易患口蹄，这种疾病通常不会杀死动物。但是，它可以大大减少牛奶和肉类的产量，给小农带来困难。

口蹄疫也会对国民经济产生重大影响。“在口蹄疫无国家，口蹄疫的入侵可能导致严重的损失，因为强制性的等级限制和随后的根除疾病所需的控制措施，”科伦特博士说。“在英国，当我们在2001年爆发时，必须宰杀动物，给养殖业带来巨大的成本。”据估计，这次爆发造成英国60亿英镑的损失(当前美元约为120亿美元，或大约相当于爆发时每名英国公民200美元的当前美元)。

“开发环境监测方法有双重好处;新的监测技术可以支持对口蹄疫无国家爆发的强有力的反应，但也可以在流行国家实施，作为补充当前流行病学信息的监测计划的一部分，”科伦特博士说。口蹄疫目前在亚洲，非洲和中东的部分地区流行。

口蹄疫是由Aphthovirus属的一个成员引起的。它会导致牛，山羊，猪和其他偶蹄哺乳动物的口腔和脚部出现水泡。该病毒含有编码其基因组的单链RNA。