布罗德研究所(Broad Institute)的科学家和他们的合作者发表的最新研究。

儿童脑瘤的治疗目标

儿童脑瘤很难治疗，尤其是当它们位于大脑中线结构，如脑干或丘脑时。在《自然通讯》杂志上，prassida Khadka, Zach Reitman(杜克大学)，癌症项目副成员Mimi Bandopadhayay，研究所科学家和蛋白质组学平台高级主管Steven Carr, Timothy phoenix(辛辛那提大学)及其同事研究了ppM1D基因的关键突变，这是一种先前在弥漫性中线神经胶质瘤（diffuse midline gliomas）中发现的基因。他们发现ppM1D突变不仅导致了对放射治疗的耐药性，而且还有助于形成新的肿瘤。他们还发现MDM2是ppM1D的一个靶点，是一个很有前途的药物靶点。他们的发现为未来治疗方法的发展提供了线索。

Nature利用类器官探索自闭症风险基因

数以百计的基因和位点与自闭症谱系障碍有关，但个体突变影响大脑的机制尚不清楚。在《自然》杂志上，Bruna paulsen, Silvia Velasco, Amanda Kedaigle, Martina pigoni，研究所成员paola Arlotta，以及来自斯坦利精神病学研究中心、麻省理工学院卡拉曼细胞观察中心和哈佛大学干细胞和再生生物学系(HSCRB)的同事们发现了三个自闭症风险基因的突变SUV420H1、ARID1B和CHD8——都改变了特定神经元的发育时间，其影响取决于细胞的基因组背景。研究小组对大脑皮层器官模型中的3个基因进行了研究，得出了上述结论。

Cell肠道反应

拟杆菌属(Bacteroides)是人类肠道的主要革兰氏阴性菌，其生存取决于每种菌株利用膳食和宿主糖的能力。Sun-Yang park(波士顿儿童医院)、IDMp联合成员、波士顿儿童医院的Seth Rakoff-Nahoum和其他人表明，一种微生物衍生的小分子，丁酸盐，是一种上下文依赖的拟杆菌类抑制剂，作为一种适应开关，依赖于使用哪种特定的糖。拟杆菌属中酰基辅酶A代谢的功能和调节的遗传变异影响丁酸盐的抑制作用。这项工作证明了自底向上的方法在揭示决定微生物群成员适应性的力量方面的威力。

重新定义丘脑的遗传多样性

丘脑是前脑的中心结构，负责从感觉处理到注意力和记忆的广泛功能。在发表在《自然神经科学》杂志上的一篇评论文章中，Dheeraj Roy、斯坦利中心的研究所成员Guoping Feng及其同事综合了丘脑独特结构的最新研究，这种结构产生了丘脑的各种功能。虽然之前的研究指出，丘脑中存在遗传上截然不同的细胞群，但现代单细胞分析表明，这些神经元实际上表现出基因表达的梯度。作者提出了一种新的方法来描述丘脑内的功能亚单位使用基因表达配对连接和计算。

一种分析疾病相关基因集的新方法

识别在GWAS数据中富集的基因类可以对疾病产生深入了解。然而，将GWASs识别出的单核苷酸多态性与特定的基因联系起来是一个挑战。在《美国人类遗传学杂志》上，Katherine Siewert-Rocks，医学和人口遗传学项目的副成员Alkes price和同事们报告了基因共调节得分回归(GCSC)。GCSC使用基于全转录组关联研究的框架，确定了通过因果基因的预测表达来解释疾病遗传力的丰富基因。该研究小组发现，GCSC分析比一些相关方法具有更高的能力，并确定了互补基因组。

单细胞观察肠道炎症

成纤维细胞是为组织结构提供框架的细胞;它们还介导许多细胞过程，并可导致纤维结缔组织的病理形成。由Guadalupe Jasso、博士后助理Alok Jaiswal、IDMp核心成员Ramnik Xavier和IDMp功能基因组学主任、研究所科学家Daniel Graham领导的团队，研究了成纤维细胞、炎症、以及结肠细胞的组织损伤以更好地了解炎症性肠病。小鼠的单细胞RNA分析揭示了胃肠道粘膜组织中不同的成纤维细胞群体，并揭示了在结肠炎期间控制炎症和组织重塑的分子回路。