摘要

研究通过新一代RNA测序评估了EBV病毒和一种由病毒编码的BART长非编码RNA（lncRNAs）对体外上皮细胞表达的影响，以及在免疫缺陷小鼠体内肿瘤中对细胞表达的影响。基于基因表达的分层聚类分析能够将细胞系与肿瘤区分开来，能够区分EBV阳性肿瘤和BART肿瘤与EBV阴性肿瘤。EBV和BART的表达还可诱导细胞microRNAs（miRs）和lncRNAs的特异性表达变化。体内表达的变化表明生长途径受到抑制，反映了在所有肿瘤中细胞miRs的表达增加。在EBV和BART肿瘤中，许多诱导的细胞mir的靶点没有改变，并且发现非功能mir的种子序列在BART lncRNA内有同源区域。结合这些诱导miR对已知靶点的作用被抑制，表明这种抑制是由于BART lncRNA的海绵作用而其功能降低。体内基因表达的主要变化很可能是通过对细胞非编码RNA的影响而介导的。此外，BART-lncRNA的一个预测特性是功能性地抑制诱导的细胞miRs。在BART-lncRNA中发现了与这些mir种子序列高度同源的区域。这些发现提示BART-lncRNA是生长抑制miRs的海绵。

EBV是一种主要的致癌病毒，与多种淋巴系统恶性肿瘤的发生有关。EBV病毒基因表达的不同模式通常与不同恶性肿瘤的特征相关，在细胞系和异种移植物中也可以观察到。体外感染的B淋巴细胞表达8种病毒蛋白和几种非编码RNA，被认为是III型潜伏；而在感染的鼻咽癌细胞表达EBNA1、潜伏膜蛋白1（LMp1）、潜伏膜蛋白2（LMp2）、pol III、EBV编码RNAs（EBER）和BART（Bam HI A rightward transcript）RNAs，被认为是II型潜伏。EBV特征表达最早是在鼻咽癌中发现的，其中未检测到EBNA2和EBNA3的编码序列，而在BamHI A区检测到大量转录本。这些转录本由一个非B淋巴细胞转染所必需的特定区域编码，这些丰富的polyA化的RNA有着复杂剪接，不同的剪接可形成潜在的开放阅读框。BART RNAs随后被证明是44个由内含子产生的病毒编码的microRNAs（miR）的模板，而经过加工剪接多聚腺苷酸化的BART RNAs仍然留在核内，显然其功能是作为非编码RNA（lncRNAs）。

AGS细胞系是从EBV阴性的胃腺瘤中建立的，是少数能感染EBV的上皮细胞系之一。EBV感染AGS细胞导致1型潜伏，表达EBNA1，可能是LMp2和BART RNAs。与鼻咽癌异种移植瘤的比较表明，EBV阳性胃细胞的表达与鼻咽癌有很大不同。